More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2815 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2815  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  42.05 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  41.79 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  41.77 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  41.79 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  41.1 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1634  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  38 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  35.44 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.68 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  43.48 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  38.3 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  38.75 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0892  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3369  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.84 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  33.72 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  33.72 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0944  ArsR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0399  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.875603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  47.69 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  40.24 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  38.16 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  38.57 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  35.71 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  38.57 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  34.72 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>