More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2699 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 142 aa  270  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0892  ArsR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0944  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 131 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  46.24 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  48.91 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  44.19 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  47.31 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  53.33 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  40.7 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3640  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  45.45 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3929  transcriptional regulator, ArsR family  44.9 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4145  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  46.84 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  40.22 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3740  ArsR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  39.36 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  36.84 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  58.93 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0854  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  48.48 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  51.52 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  52.05 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  30.2 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2472  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  50 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000355977  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1683  ArsR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  38.67 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  40.24 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  44.3 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2719  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.44 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4102  transcriptional regulator ArsR family  45.16 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00250446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  45.57 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>