More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1714 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0860  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0886  transcriptional regulator, ArsR family  45.88 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4437  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.352064  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  41.3 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.21 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  34.88 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  36.05 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  37.21 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  37.08 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  32.94 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.21 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  40.22 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  32.18 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  39.47 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  34.88 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
114 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
135 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  31.4 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  39.76 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
116 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
120 aa  57  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  34.25 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  31.03 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2129  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000391654  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  29.17 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>