More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29211 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  100 
 
 
101 aa  203  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 
114 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  41.84 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  45.57 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  45.78 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  44.19 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  40.7 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  41.46 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  34.38 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  34.38 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0687  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 
115 aa  62  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
111 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
317 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
317 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  30.23 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  36.59 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  39.24 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  43.84 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  40 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
121 aa  57  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 
114 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  39.53 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  32.65 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  38.67 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  34.18 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
328 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  34.18 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  36.36 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  40.26 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  33.75 
 
 
95 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1768  regulatory protein ArsR  44.12 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36710  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.944272 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  37.97 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  37.97 
 
 
119 aa  53.5  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  34.92 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  32.5 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  37.18 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  36.71 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  34.78 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>