More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1504 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1504  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 110 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  51 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  43.96 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  45.45 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  27.66 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  27.66 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  42.17 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  42.17 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  48.75 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  43.88 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  31.52 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  44.71 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.43 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  41.98 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 297 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  30.59 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 226 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  45.74 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  45.98 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  35.8 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.94 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  40.19 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.75 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  36.54 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  39.53 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  42.11 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 354 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  41.86 
 
 		 349 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 337 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1776  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2441  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.372418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1821  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0345143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  45.31 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 317 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  41.49 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  31.65 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>