More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4065 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  243  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  72.45 
 
 		 100 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  69.39 
 
 		 100 aa  146  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 109 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  64.29 
 
 		 100 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  64.29 
 
 		 100 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  64.65 
 
 		 102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 100 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 101 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 102 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  63.92 
 
 		 100 aa  133  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 101 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 101 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 101 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 101 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 101 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 101 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  65.96 
 
 		 96 aa  133  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  65.31 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 165 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.22 
 
 		 97 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  61.22 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.2 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  60.2 
 
 		 104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  60.44 
 
 		 95 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  59.78 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  46 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  44.55 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  47.67 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 		 100 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  47.83 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  47 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 100 aa  87  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  47 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  43.16 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  40.66 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  34.52 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  31.25 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  38.55 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  30.49 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  30.49 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 155 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0712  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1369  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0329  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0217385  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  32.58 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  35 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  32.61 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1190  ArsR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>