204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18400 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  100 
 
 
101 aa  211  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  87.13 
 
 
101 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  87.78 
 
 
90 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  59 
 
 
100 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  51.49 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 
97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
100 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  49.5 
 
 
104 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
100 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  51.55 
 
 
104 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  58 
 
 
100 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  49.5 
 
 
100 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  49.5 
 
 
100 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
100 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.54 
 
 
97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  57 
 
 
100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
106 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  56 
 
 
100 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  51.02 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
102 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
102 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
102 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  53.68 
 
 
96 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  56.98 
 
 
100 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
102 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
102 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
102 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
102 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  47.96 
 
 
100 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
100 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
101 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
101 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
165 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  52.08 
 
 
100 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
101 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
101 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
101 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
101 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 
101 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  46.53 
 
 
100 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  46 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  47.92 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  53.49 
 
 
102 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  53.49 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  45.26 
 
 
102 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  45.16 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  46.15 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  46.46 
 
 
100 aa  90.1  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 
130 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
103 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.26 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.56 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  41.84 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  29.35 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 
96 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 
95 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 
95 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  30 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  30.61 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  33.68 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
107 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  31.52 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>