114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6910 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 100 aa  209  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  97 
 
 		 100 aa  203  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  74.49 
 
 		 99 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  74.49 
 
 		 99 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  74.49 
 
 		 99 aa  164  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  74.49 
 
 		 99 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  73.47 
 
 		 99 aa  156  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  72.45 
 
 		 99 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  42.39 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 		 98 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  46.91 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 100 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  45.56 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  41.38 
 
 		 100 aa  76.6  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  40.26 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  36.96 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  33.67 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.23 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  37.23 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  67  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  34.41 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  34.15 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 100 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  34.38 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  30.86 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  38.6 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4158  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000881088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4504  transcriptional regulator, ArsR family  38.33 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  35.19 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4509  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.879299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4321  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4169  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.559652  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4655  ArsR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.337504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0191  transcriptional regulator, ArsR family  39.34 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0062  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  38.6 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3321  transcriptional regulator, ArsR family  26.32 
 
 		 350 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  31.67 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  29.9 
 
 		 105 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  30.12 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 94 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  31.65 
 
 		 104 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 317 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  27.37 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  25.68 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  29.27 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  32.08 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>