92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6888 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
100 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  50.53 
 
 
100 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  51.52 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  49.47 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  51.58 
 
 
100 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  51.65 
 
 
102 aa  90.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
102 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
101 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
101 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
101 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
101 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
101 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
101 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  53.26 
 
 
101 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  48.98 
 
 
100 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  44.44 
 
 
100 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
102 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
102 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
102 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
100 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  46.08 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.46 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
115 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  48.08 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  41.84 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  40.22 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  37.63 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  33.33 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  38.64 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  32 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  31.96 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  36.96 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
103 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 
100 aa  59.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 
100 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
106 aa  52  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  38.78 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  39.73 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5353  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5643  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5264  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
268 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3372  regulatory protein, ArsR  38.67 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1841  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0064194  normal  0.0655813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3162  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  41.54 
 
 
113 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
114 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4671  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
337 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2919  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.808168  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  27.08 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
110 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2681  regulatory protein, ArsR  31.33 
 
 
113 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  0.0738216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>