282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4149 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  99.02 
 
 		 102 aa  209  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  95.1 
 
 		 102 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  95.1 
 
 		 102 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  95.1 
 
 		 102 aa  203  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  93.14 
 
 		 102 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  91.18 
 
 		 102 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  72.45 
 
 		 100 aa  150  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 100 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 101 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 101 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 101 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 101 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 101 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 101 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 101 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  70 
 
 		 109 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  66.67 
 
 		 100 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 100 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  66.67 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  68.37 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 117 aa  139  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  66.67 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  66.67 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  64 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  63.92 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  60.2 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  62.77 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  59.18 
 
 		 97 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  60.42 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  56.52 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  51.52 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  53.61 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 		 100 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  50.55 
 
 		 100 aa  97.4  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  46.94 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  48 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  51 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  42 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.35 
 
 		 100 aa  92  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 100 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  49.04 
 
 		 100 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.37 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.76 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  33.71 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0733  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  31.68 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 98 aa  50.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  29.7 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0303  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3094  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2227  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1304  transcriptional regulator, ArsR family  31.71 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3194  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3288  transcriptional regulator, ArsR family  36.27 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0616099  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  38.64 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4024  transcriptional regulator, ArsR family  27.91 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0486243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1295  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.780199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  35.53 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  35.53 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318119  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000176438  normal  0.676383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>