More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3384 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  69.31 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  62.38 
 
 		 100 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  57 
 
 		 100 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  58.42 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  57 
 
 		 100 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  56 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37790  ArsR family regulatory protein  53.12 
 
 		 100 aa  106  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3893  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0868  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4356  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4298  regulatory protein, ArsR  48.54 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1336  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1152  regulatory protein, ArsR  46.39 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0987  ArsR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1246  regulatory protein ArsR  51.04 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.675599  normal  0.257925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  51.14 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3604  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4763  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5520  ArsR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.906756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 97 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1467  regulatory protein ArsR  52.13 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 165 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18400  regulatory protein, ArsR family  47.92 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1211  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.418515  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06305  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.91 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0903  ArsR family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0846  ArsR family transcriptional regulator  57.32 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.760794  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1355  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2475  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  49 
 
 		 97 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0339  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0618  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.982996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1284  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563641  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0952  ArsR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0921  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0964497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1284  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4467  ArsR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0960  regulatory protein, ArsR  47.73 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2484  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 101 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  53.41 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  53.41 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4065  ArsR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  55.81 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1476  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2912  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5640  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.694385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4824  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337473  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5129  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3342  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4173  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3142  transcriptional regulator ArsR family  46.74 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3270  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1845  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2954  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6910  putative transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 100 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772723  normal  0.418498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5009  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799446  normal  0.0692077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1732  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.44825  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6888  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1936  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  35.64 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  35.64 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  29 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  29.79 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  30.53 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  30.77 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  33.72 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  29.59 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  30.53 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  31.52 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  29.29 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  31.18 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0720  regulatory protein ArsR  28.57 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.849038  normal  0.217468 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  32.56 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  31.87 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  28.87 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>