More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0417 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  70.54 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 115 aa  158  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  66.06 
 
 		 116 aa  151  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 114 aa  147  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 114 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 114 aa  147  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  65.77 
 
 		 114 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 114 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  64.86 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  62.39 
 
 		 145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  64.86 
 
 		 114 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  61.47 
 
 		 115 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  60.55 
 
 		 118 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  60.55 
 
 		 115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  60.91 
 
 		 116 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  59.63 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  59.63 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  58.72 
 
 		 115 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  55.86 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 275 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  54.95 
 
 		 305 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  54.05 
 
 		 270 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  55.45 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  55.77 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 110 aa  123  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  53.7 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  52.68 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 258 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.51 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  52.04 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  52.25 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  58.54 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  60 
 
 		 113 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  60 
 
 		 113 aa  106  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  60 
 
 		 113 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  52.44 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  55.42 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  54.76 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.462226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  54.76 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  54.76 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  54.76 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  54.76 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  54.76 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  54.76 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  54.76 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  53.66 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  58.97 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  54.76 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  53.57 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  46.32 
 
 		 248 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  46.34 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  46.6 
 
 		 134 aa  84.3  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  53.42 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  55.38 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  51.22 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  44.68 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  46.48 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3414  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218982  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  46.39 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  48.57 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 317 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4077  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  48.53 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.61 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  38.61 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  38.61 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  48.57 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0755  transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.554367  normal  0.0268545 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>