More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1483 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1483  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
135 aa  265  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  49.12 
 
 
128 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  49.14 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  50.44 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  49.11 
 
 
116 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2400  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00774399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  50.43 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1519  ArsR family transcriptional regulator  55.68 
 
 
258 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.760386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  45.61 
 
 
115 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  45.61 
 
 
115 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  44.74 
 
 
115 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
114 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
115 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3398  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
114 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.88548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
114 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  41.59 
 
 
114 aa  103  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
114 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
115 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
114 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.98 
 
 
140 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
116 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  56.67 
 
 
110 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  47 
 
 
110 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 
117 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  50 
 
 
113 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
115 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2718  arsenic resistance transcriptional regulator  42.98 
 
 
115 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.61 
 
 
117 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  42.61 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  43.36 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  52.81 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  43.36 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3034  regulatory protein, ArsR  43.1 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  43.36 
 
 
114 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  41.74 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  41.74 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.74 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  43.36 
 
 
114 aa  97.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.87 
 
 
117 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2713  ArsR family transcriptional regulator  48.51 
 
 
114 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  40.87 
 
 
117 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3415  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  50 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.64554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  44.66 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  43.4 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  48.84 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2819  transcriptional regulator, ArsR family  44.32 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2969  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.530376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1608  transcriptional regulator, ArsR family  49.44 
 
 
124 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.15786  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
275 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  39.8 
 
 
248 aa  85.5  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4255  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.35 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0970362 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1138  regulatory protein, ArsR  44.05 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3552  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.7 
 
 
305 aa  84  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4004  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.17 
 
 
270 aa  83.6  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002125  transcriptional regulator ArsR family  44.58 
 
 
111 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  43.33 
 
 
115 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1112  regulatory protein, ArsR  50.56 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00297  transcriptional regulator  40.96 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0586  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.516582  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1075  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
107 aa  80.1  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000458748  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1386  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  52.24 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1224  transcriptional regulator, ArsR family  34.86 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  43.37 
 
 
336 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  45.57 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.9 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  37.97 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0522  ArsR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1644  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  41.98 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  30.95 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3941  regulatory protein ArsR  45.33 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 
354 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  42.53 
 
 
349 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  37.61 
 
 
337 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  32.95 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  35.79 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  50.77 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  44 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000881945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>