27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0903 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0903  putative transcriptional regulator, PaaX family  100 
 
 		 102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1985  hypothetical protein  52.63 
 
 		 138 aa  103  8e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0473158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2510  PaaX family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243974  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2947  hypothetical protein  53.49 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5099  hypothetical protein  52.27 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5187  hypothetical protein  52.27 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5478  hypothetical protein  52.27 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3171  PaaX family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3693  hypothetical protein  49.45 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3464  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  normal  0.657891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0330  hypothetical protein  51.76 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5016  hypothetical protein  46.15 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3612  hypothetical protein  47.13 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1036  hypothetical protein  47.13 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  42.17 
 
 		 280 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_002936  DET0907  hypothetical protein  48.28 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7181  hypothetical protein  45.88 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_779  transcriptional regulator  47.13 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0792  transcriptional regulator, TrmB  47.13 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1154  hypothetical protein  57.14 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4855  hypothetical protein  43.02 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5291  hypothetical protein  40.7 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5180  transcriptional regulator, ArsR family  35.48 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2283  regulatory protein, ArsR  37.74 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4059  regulatory protein, ArsR  37.74 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.507544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04390  predicted transcriptional regulator  39.62 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1926  regulatory protein ArsR  43.14 
 
 		 99 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>