22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3612 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3612  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5016  hypothetical protein  64.04 
 
 
95 aa  120  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3171  PaaX family transcriptional regulator  56.44 
 
 
109 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2947  hypothetical protein  57.61 
 
 
106 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2510  PaaX family transcriptional regulator  58.43 
 
 
106 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243974  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1985  hypothetical protein  60.27 
 
 
138 aa  94.4  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0473158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0330  hypothetical protein  56.1 
 
 
112 aa  94  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5099  hypothetical protein  45.98 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5187  hypothetical protein  45.98 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17905  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5478  hypothetical protein  45.98 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0903  putative transcriptional regulator, PaaX family  47.13 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7181  hypothetical protein  43.48 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164495  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1036  hypothetical protein  42.42 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  46.91 
 
 
280 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4855  hypothetical protein  39.58 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337382  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5291  hypothetical protein  43.04 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1154  hypothetical protein  59.32 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3693  hypothetical protein  40.66 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3464  putative transcriptional regulator  44.59 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  normal  0.657891 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_779  transcriptional regulator  40.54 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0792  transcriptional regulator, TrmB  40.54 
 
 
111 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0907  hypothetical protein  40.54 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>