22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1154 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1154  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2510  PaaX family transcriptional regulator  72.92 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243974  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2947  hypothetical protein  73.97 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3171  PaaX family transcriptional regulator  72.6 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1985  hypothetical protein  58.73 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0473158  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3612  hypothetical protein  59.32 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0903  putative transcriptional regulator, PaaX family  57.14 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7181  hypothetical protein  60.34 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  48.68 
 
 		 280 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5291  hypothetical protein  39.8 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4855  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5016  hypothetical protein  47.76 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3693  hypothetical protein  43.28 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1036  hypothetical protein  51.72 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5478  hypothetical protein  48.33 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5187  hypothetical protein  48.33 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5099  hypothetical protein  48.33 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0330  hypothetical protein  51.72 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3464  putative transcriptional regulator  48.21 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  normal  0.657891 
 
 
-
 
NC_002936  DET0907  hypothetical protein  46.43 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10626  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_779  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0792  transcriptional regulator, TrmB  44.64 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>