24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1036 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1036  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  253  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5099  hypothetical protein  53.33 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5187  hypothetical protein  53.33 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5478  hypothetical protein  53.33 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3171  PaaX family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2947  hypothetical protein  52.81 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1985  hypothetical protein  51.76 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0473158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3693  hypothetical protein  51.76 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3464  putative transcriptional regulator  54.02 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  normal  0.657891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0330  hypothetical protein  52.94 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2510  PaaX family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243974  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5291  hypothetical protein  47.78 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4855  hypothetical protein  47.92 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0903  putative transcriptional regulator, PaaX family  47.13 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5016  hypothetical protein  45.35 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7181  hypothetical protein  43.68 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3612  hypothetical protein  42.42 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0792  transcriptional regulator, TrmB  46.99 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0907  hypothetical protein  46.99 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  41.67 
 
 		 280 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_779  transcriptional regulator  46.99 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1154  hypothetical protein  51.72 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 174 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1426  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.134473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>