24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0907 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0907  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10626  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0792  transcriptional regulator, TrmB  90.09 
 
 		 111 aa  203  8e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_779  transcriptional regulator  90.09 
 
 		 111 aa  200  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3464  putative transcriptional regulator  51.16 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  normal  0.657891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5099  hypothetical protein  48.24 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0903  putative transcriptional regulator, PaaX family  48.28 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5187  hypothetical protein  48.24 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5478  hypothetical protein  48.24 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1985  hypothetical protein  45.35 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0473158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2947  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3171  PaaX family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1036  hypothetical protein  46.99 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0330  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2510  PaaX family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243974  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5291  hypothetical protein  40.96 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4855  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3693  hypothetical protein  38.64 
 
 		 106 aa  66.6  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7181  hypothetical protein  38.78 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5016  hypothetical protein  40.96 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  33.73 
 
 		 280 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3612  hypothetical protein  40.54 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1154  hypothetical protein  46.43 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000192814  hitchhiker  0.0000168087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  28 
 
 		 410 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>