24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7181 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7181  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  295  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5291  hypothetical protein  65.93 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4855  hypothetical protein  66.28 
 
 		 117 aa  120  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  62.07 
 
 		 280 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2947  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3171  PaaX family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2510  PaaX family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243974  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1985  hypothetical protein  53.93 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0473158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3464  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  normal  0.657891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5016  hypothetical protein  50.55 
 
 		 95 aa  87.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3612  hypothetical protein  43.48 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1036  hypothetical protein  43.68 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0903  putative transcriptional regulator, PaaX family  45.88 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1154  hypothetical protein  60.34 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3693  hypothetical protein  37.21 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5478  hypothetical protein  39.77 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5187  hypothetical protein  39.77 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5099  hypothetical protein  39.77 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0792  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0330  hypothetical protein  41.43 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_779  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0907  hypothetical protein  38.78 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10626  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  40.38 
 
 		 292 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>