23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4855 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4855  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.337382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5291  hypothetical protein  74.74 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7181  hypothetical protein  66.28 
 
 		 148 aa  120  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  56.12 
 
 		 280 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2947  hypothetical protein  55.29 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1985  hypothetical protein  54.65 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0473158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3171  PaaX family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3464  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101218  normal  0.657891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1036  hypothetical protein  47.92 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2510  PaaX family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243974  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5016  hypothetical protein  49.47 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0330  hypothetical protein  42.35 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3612  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5187  hypothetical protein  40.2 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.17905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5478  hypothetical protein  40.2 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0903  putative transcriptional regulator, PaaX family  43.02 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5099  hypothetical protein  40.2 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3693  hypothetical protein  38.64 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1154  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0792  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_779  transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0907  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>