More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1224 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  63.6 
 
 		 507 aa  668    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 699 aa  1424    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 527 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  43.25 
 
 		 549 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  41.11 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  41.63 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  39.4 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 550 aa  383  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  40.52 
 
 		 544 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  38.34 
 
 		 551 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.21 
 
 		 541 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.44 
 
 		 537 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.44 
 
 		 537 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.44 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.44 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.44 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.84 
 
 		 537 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.44 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.24 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916006 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.24 
 
 		 537 aa  369  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 537 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.42 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.24 
 
 		 537 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2639  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.92 
 
 		 480 aa  364  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  39.03 
 
 		 546 aa  364  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0905  AMP-dependent synthetase and ligase  40.52 
 
 		 547 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 		 545 aa  362  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0471179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1316  AMP-dependent synthetase and ligase  40.89 
 
 		 546 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.4 
 
 		 545 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.64 
 
 		 543 aa  362  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.6 
 
 		 545 aa  360  5e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.38 
 
 		 569 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 		 533 aa  360  6e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1907  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.38 
 
 		 569 aa  360  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.45334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.38 
 
 		 547 aa  360  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.049446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.95 
 
 		 547 aa  359  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.6 
 
 		 545 aa  359  8e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  40.32 
 
 		 544 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0380  putative acyl-CoA synthetase  37.55 
 
 		 545 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 		 546 aa  357  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 		 539 aa  357  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 		 546 aa  357  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.87 
 
 		 542 aa  357  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 		 546 aa  357  5e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1367  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.43 
 
 		 547 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0878998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.44 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 575 aa  354  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.44 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.44 
 
 		 543 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5305  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.32 
 
 		 549 aa  354  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 549 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.46 
 
 		 542 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  39.68 
 
 		 552 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.18 
 
 		 547 aa  353  8e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 		 538 aa  352  8.999999999999999e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  39.68 
 
 		 540 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.4 
 
 		 545 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4589  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.18 
 
 		 538 aa  352  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.335072  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1027  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.78 
 
 		 560 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  38.01 
 
 		 542 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 		 547 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  37.99 
 
 		 549 aa  351  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.58 
 
 		 584 aa  350  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  41.47 
 
 		 542 aa  349  8e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2275  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.6 
 
 		 562 aa  349  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0961938  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  37.98 
 
 		 542 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1180  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 534 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.941071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 549 aa  348  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 		 546 aa  347  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1925  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.73 
 
 		 561 aa  347  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113828  normal  0.439232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8848  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 541 aa  347  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1165  putative acyl-CoA synthetase  37.5 
 
 		 542 aa  346  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431504  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.65 
 
 		 542 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 551 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.29 
 
 		 541 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4136  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 587 aa  346  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 546 aa  345  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1799  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.18 
 
 		 547 aa  345  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.38 
 
 		 542 aa  343  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.07 
 
 		 536 aa  343  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0444  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 		 542 aa  343  7e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 550 aa  342  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  38.46 
 
 		 542 aa  342  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4934  putative acyl-CoA synthetase  36.9 
 
 		 542 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  36.97 
 
 		 542 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1439  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.64 
 
 		 544 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4392  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 542 aa  340  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.64 
 
 		 544 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.641249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1203  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.64 
 
 		 544 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.64 
 
 		 544 aa  340  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.87 
 
 		 542 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0605  AMP-dependent synthetase and ligase  37.88 
 
 		 516 aa  340  7e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.194166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2335  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.57 
 
 		 546 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2296  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.57 
 
 		 546 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.42 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2141  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 		 589 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2845  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 540 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>