More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0798 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0798  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 552 aa  1094    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  43.09 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  45.27 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.67 
 
 		 537 aa  421  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.99 
 
 		 537 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.17 
 
 		 537 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.17 
 
 		 537 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.17 
 
 		 537 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.99 
 
 		 537 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.73 
 
 		 537 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.67 
 
 		 537 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.17 
 
 		 537 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  42.99 
 
 		 544 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  44.96 
 
 		 544 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2275  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.23 
 
 		 562 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0961938  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  44.13 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  42.16 
 
 		 533 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.09 
 
 		 558 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1925  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.48 
 
 		 561 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113828  normal  0.439232 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  43.74 
 
 		 552 aa  398  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1843  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.93 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.26 
 
 		 547 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.87 
 
 		 545 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.37 
 
 		 542 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  43.39 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.34 
 
 		 546 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.93 
 
 		 546 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.45 
 
 		 547 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.7 
 
 		 547 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.049446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1799  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.71 
 
 		 547 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.9 
 
 		 543 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  41.43 
 
 		 550 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.56 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1907  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.21 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.45334  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.51 
 
 		 569 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.56 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.56 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.74 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4187  AMP-dependent synthetase and ligase  41.04 
 
 		 545 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554867  normal  0.517417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.74 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1027  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.5 
 
 		 560 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42 
 
 		 584 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.8 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  42.18 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1316  AMP-dependent synthetase and ligase  45.01 
 
 		 546 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 		 544 aa  388  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 543 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.49 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  41.05 
 
 		 565 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0328  AMP-dependent synthetase and ligase  41.46 
 
 		 540 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1439  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.35 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2932  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.33 
 
 		 547 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0465511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.35 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.641249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 		 575 aa  385  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.35 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  41.2 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1203  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.35 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1367  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.28 
 
 		 547 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0878998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3973  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.12 
 
 		 545 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2335  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.9 
 
 		 546 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0905  AMP-dependent synthetase and ligase  40.94 
 
 		 547 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 		 536 aa  382  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  38.76 
 
 		 546 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2296  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.9 
 
 		 546 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2456  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.75 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.63 
 
 		 542 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4358  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.11 
 
 		 549 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.124731 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  41.48 
 
 		 550 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 		 538 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8848  AMP-dependent synthetase and ligase  42.32 
 
 		 541 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2141  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.64 
 
 		 589 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 546 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.02 
 
 		 542 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  42.59 
 
 		 542 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.21 
 
 		 542 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5305  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.71 
 
 		 549 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  39.11 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.92 
 
 		 542 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 533 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0260985  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.62 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.78 
 
 		 541 aa  369  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  39.68 
 
 		 699 aa  368  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 		 546 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4589  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.42 
 
 		 538 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.335072  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 549 aa  364  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.9 
 
 		 541 aa  363  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0437  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 		 547 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 965 aa  360  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0759  putative acyl-CoA synthetase  37.73 
 
 		 542 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 		 547 aa  357  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  37.31 
 
 		 542 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1180  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 		 534 aa  356  5.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.941071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 549 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 551 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0605  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.194166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2845  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  42.3 
 
 		 527 aa  352  7e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>