More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1286 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1286  transcriptional regulator, ArsR family/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  100 
 
 
244 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1105  transcriptional regulator, ArsR/dinitrogenase iron-molybdenum cofactor family protein  95.08 
 
 
244 aa  467  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0728142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2820  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  50.4 
 
 
125 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0426  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  52.46 
 
 
126 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3595  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  43.9 
 
 
125 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.501304  normal  0.261941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16640  hypothetical protein  29.89 
 
 
266 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0996  hypothetical protein  36.57 
 
 
135 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1076  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.54 
 
 
122 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.230109  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2606  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.41 
 
 
129 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000531287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1553  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  40 
 
 
122 aa  85.5  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000698293  decreased coverage  0.0000195705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1324  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.88 
 
 
122 aa  85.1  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1553  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1147  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.77 
 
 
122 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0637681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0218  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0559  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.78 
 
 
119 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0997292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1457  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.88 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.443694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0907  hypothetical protein  34.68 
 
 
122 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.603611  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1391  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
85 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018666  unclonable  0.00000780162 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1833  hypothetical protein  31.93 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0620  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.77 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2839  metal-regulated homodimeric transcriptional regulator  39.19 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
94 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  35.83 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1819  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.83 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
109 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2079  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.09 
 
 
126 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
107 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0175  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.45 
 
 
117 aa  59.7  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
100 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  31.91 
 
 
115 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0627  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
103 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.960217  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
120 aa  59.3  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 
111 aa  58.9  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0656  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.75 
 
 
117 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000343998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 
119 aa  58.9  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 
122 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
105 aa  58.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1283  hypothetical protein  25.21 
 
 
123 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00697466  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 
125 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1229  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.11 
 
 
131 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3521  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
368 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5266  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 
368 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
124 aa  56.6  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  38.75 
 
 
104 aa  56.6  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  38.16 
 
 
124 aa  56.6  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 
124 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1863  protein of unknown function DUF134  29.51 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
108 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  36.36 
 
 
102 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
124 aa  55.8  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 
119 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 
123 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0870  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
85 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0436656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3644  regulatory protein ArsR  35 
 
 
146 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45994  normal  0.88589 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
96 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
122 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
125 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
98 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 
107 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  36.14 
 
 
123 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0593  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.17 
 
 
126 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.723259 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 
118 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  40 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 
116 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 
121 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0192  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.93 
 
 
132 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.265871  normal  0.553673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.08 
 
 
140 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
103 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
117 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
116 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0192  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.25 
 
 
122 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
114 aa  53.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
123 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  39.73 
 
 
119 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  36.71 
 
 
109 aa  52.8  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  40.85 
 
 
89 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3390  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
115 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 
123 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  38.03 
 
 
106 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  41.54 
 
 
118 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 
108 aa  52.4  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  38.03 
 
 
106 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
107 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
297 aa  52.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
120 aa  52  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
119 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
125 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  30.77 
 
 
107 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>