18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3139 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3139  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 77 aa  156  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0099  transcriptional regulator, PadR-like family  60 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0888  regulatory protein ArsR  37.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.844031  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  33.8 
 
 		 263 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  40.3 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 		 250 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  41.1 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 249 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8127  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1231  transcriptional regulator, TrmB  32.86 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>