More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1163 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  30.17 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  31.85 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  29.38 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  32.2 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  28.89 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  33.61 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  31.97 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  27.69 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  30.89 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  27.32 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  29.63 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  24.37 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  31.36 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  33.6 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  28.93 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  32.03 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  25.62 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  31.71 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  35.65 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  30.39 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  43.42 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  32.11 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  23.75 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 372 aa  55.5  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  30.69 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  37.18 
 
 		 121 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  24.54 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  31.53 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  34.29 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  37.97 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  42.03 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  40 
 
 		 109 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 121 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  31.4 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  37.97 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 127 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  44.16 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  31.91 
 
 		 114 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  23.93 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  23.93 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  23.93 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  23.93 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  29.03 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 114 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  30.3 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  30.58 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 103 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 111 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 263 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5629  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 102 aa  52.4  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 111 aa  52  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  26.45 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 121 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>