142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3702 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  73.89 
 
 		 227 aa  288  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  69.35 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  63.68 
 
 		 202 aa  250  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  62.74 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  64.04 
 
 		 201 aa  238  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  65.73 
 
 		 213 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  58.77 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  64.2 
 
 		 199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  62.22 
 
 		 209 aa  217  7.999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 203 aa  205  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 272 aa  191  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  53.59 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  50.48 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  50.75 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  54.14 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  57.23 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  55.11 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  50.97 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 181 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  53.67 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  53.14 
 
 		 180 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  51.16 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  54.94 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  45.41 
 
 		 199 aa  124  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  30.22 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  31.34 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  40.45 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  32.33 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 165 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  28.48 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  52 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  28.07 
 
 		 165 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 168 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 110 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  28.07 
 
 		 165 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  37 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 175 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  27.65 
 
 		 179 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 179 aa  48.1  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  43.86 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 121 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  29.2 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  33.75 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 108 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 118 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  26.14 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  29.67 
 
 		 316 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  30.23 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  28.06 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  35.44 
 
 		 238 aa  45.1  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  27.38 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  24.4 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  27.14 
 
 		 148 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.58 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  28.09 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  31.4 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  25.25 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  41.11 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>