More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0617 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  214  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 121 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  39 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  40 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  41.35 
 
 		 123 aa  88.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  37 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  37 
 
 		 188 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  37 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  37 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  43.3 
 
 		 118 aa  84.3  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  41.35 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  43.3 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  39.42 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  35.51 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  38.78 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.66 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  44.83 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  35.42 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  38.14 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  42.59 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  31.31 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  37.11 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  41.57 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  30.3 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  39.78 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  33.98 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  35.11 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  29.79 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  31.19 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  34.04 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  40.86 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  27.45 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  38.95 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  37 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  28.71 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  30.69 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  36.27 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  35.19 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>