259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4530 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  215  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  43.81 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  40.74 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  43.16 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 110 aa  93.6  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  43 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  44.33 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  43.27 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  41.05 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  42.86 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  43.16 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  43.16 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  43.16 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  38.1 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  38.1 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  42.11 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  42.11 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  38.95 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  33.98 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  38.95 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  37.89 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  38.95 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  34.69 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  34.34 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  34.69 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  35.79 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  37.89 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  37.25 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  33.68 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  41.43 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  43.53 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  36.84 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  36.84 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  41.56 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  34.38 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  38.95 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  34.34 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  41.56 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  35.64 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  35.79 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  35.79 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  35.79 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  35.79 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  33.96 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  35.79 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>