More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12940 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  253  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  59.48 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  58.1 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  51.92 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  43.93 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  50.49 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  44.76 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 112 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  46.6 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  37 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  44.34 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  34.31 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  47.73 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  32.35 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  47.62 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  39.6 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  34.78 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  38.6 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  34.26 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  35.51 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  34.29 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  34.29 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  38.78 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  28.43 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  33.98 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  27.72 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  28.21 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  24.51 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  27.18 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  30.61 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  31.13 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  30.61 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  26.21 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  31.73 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  27 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  37.76 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  31.37 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  37.36 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  36.54 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  37 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  29.52 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  26.21 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  30.61 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  30.61 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>