More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2728 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  94.5 
 
 		 110 aa  208  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  94.5 
 
 		 110 aa  207  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  94.5 
 
 		 110 aa  207  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  93.58 
 
 		 110 aa  206  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  92.66 
 
 		 110 aa  205  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  92.66 
 
 		 110 aa  205  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  92.66 
 
 		 110 aa  205  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  92.66 
 
 		 110 aa  204  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  92.66 
 
 		 110 aa  204  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  92.66 
 
 		 110 aa  203  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  58.72 
 
 		 109 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  61.76 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  63.11 
 
 		 105 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  62.75 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  62.75 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 105 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  62.38 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  50.48 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  50.49 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  43.69 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  42.99 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  44.66 
 
 		 108 aa  97.4  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  46.08 
 
 		 106 aa  96.7  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  40.2 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  43.69 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2071  PadR-like family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  43.69 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  40.57 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  42.72 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  42.72 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  42.72 
 
 		 106 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  42.72 
 
 		 106 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 106 aa  93.6  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 106 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  42.72 
 
 		 106 aa  93.6  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2172  transcriptional regulator, PadR-like family  42.72 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 118 aa  90.5  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  41.58 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  40.57 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  40.57 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  41.41 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  43 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  41 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  40.57 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  41.58 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  40.57 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  41.58 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  39.22 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  45 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  43 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  41.75 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  40.59 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  40.59 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  42.42 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0522  PadR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  42.57 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  38.61 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  38.83 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  35.19 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  40.59 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  40.2 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  43 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  35.24 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  40.21 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  32.35 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  37 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>