More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0216 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  61.17 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  51.4 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  53.47 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  53.47 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  53.47 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  53.47 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  51.85 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  46.73 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  53 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  48.04 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  48.04 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  48.04 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  48.04 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  42.72 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  47.52 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  47.52 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  47.52 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  47.52 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  47.52 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  47.52 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  47.52 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  42.72 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  45.71 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  44.76 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2071  PadR-like family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202752  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2172  transcriptional regulator, PadR-like family  41.58 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  40.4 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  41.75 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  35.51 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  38.38 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  38 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0522  PadR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  37.76 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  37.74 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  32.99 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  35.85 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  39 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  38.53 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  38.53 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  38.53 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  38.53 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  39.42 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  35.64 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  41.67 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  41 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  30.39 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  28.85 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2398  hypothetical protein  32.71 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0399809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2573  hypothetical protein  32.71 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  30.39 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  40.82 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2314  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2585  hypothetical protein  31.78 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46974e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2382  PadR-like family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.886804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>