298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3065 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 136 aa  267  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  67.35 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  67.01 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  56.73 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  46.88 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  50.54 
 
 		 109 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  34.91 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  44.79 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  44.9 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  45.36 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  45.36 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  39 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  35.92 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  37.11 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  43.3 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  39.18 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  45 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  37.11 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  46.15 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  35.71 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  41.94 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  36.17 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  43.3 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  40.38 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  44.94 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  44.9 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  37.14 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  34.69 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  34.69 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  32.99 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  41 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  42.27 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  35.05 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  35.05 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  35.05 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  41.24 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  42.27 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  35.05 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  39.6 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  41.24 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  36.63 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  39.78 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  43.82 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  40.59 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
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NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
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NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  46.34 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  37.37 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_2172  transcriptional regulator, PadR-like family  39.56 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  31.37 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  37 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
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NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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