More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0211 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 114 aa  226  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  58.1 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  53.27 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  57.58 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  55.21 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  48.08 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  48 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  48 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  49 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  37.5 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  45.65 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  45.26 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  37.5 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  30.69 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  42.42 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  40.22 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  40.91 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  32.69 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  43.01 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  31.73 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  39 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  29 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  30.77 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  29 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  29 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  28 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  29 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  29.79 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  42.35 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  29.81 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.52 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  32.22 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  36.89 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  30.61 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  28 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  36 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  36.56 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  27.18 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  27.52 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  34.31 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  34.31 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  34.31 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  34.31 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  29.9 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  34.31 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  34.31 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2071  PadR-like family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  34.31 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2172  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>