247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0895 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  100 
 
 		 110 aa  218  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  76.19 
 
 		 107 aa  163  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  71.84 
 
 		 111 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  71.15 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  67.89 
 
 		 109 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  63.11 
 
 		 111 aa  133  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  62.77 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  43.43 
 
 		 128 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  43.14 
 
 		 109 aa  87.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  45.1 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  41.75 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  37.04 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  43 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  36.11 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  45.36 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  42 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  40.59 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  42 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  42 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  42 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  42 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  42 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  42 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  33.01 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  41.58 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  38.61 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  38.61 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  43.3 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  38.24 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  38.24 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  37.62 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  37.62 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  37.62 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  37.62 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  37.62 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  34.26 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  38.61 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  37.25 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  37.25 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  37.25 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  37.25 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  37.25 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  35.64 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  30.19 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  40.59 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  35.64 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  35.64 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  28.85 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  42.57 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  47.56 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_2172  transcriptional regulator, PadR-like family  36.54 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  42.27 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  39.18 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
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NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2382  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.886804  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  33 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  33 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2577  hypothetical protein  33.98 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000426616  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2398  hypothetical protein  33.01 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0399809  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2573  hypothetical protein  33.01 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2585  hypothetical protein  33.01 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46974e-17 
 
 
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NC_006274  BCZK2314  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461274  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2542  hypothetical protein  33.01 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  47.44 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  32.61 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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