234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2678 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 111 aa  221  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  73.58 
 
 		 109 aa  159  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  74.76 
 
 		 109 aa  152  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  76.6 
 
 		 99 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  64.22 
 
 		 111 aa  144  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  64.15 
 
 		 107 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  63.11 
 
 		 110 aa  133  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  44.79 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  41 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  32.04 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  39.13 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  44 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  41.11 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  44.57 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  41.76 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  38.32 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  38.32 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  38.32 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  41.76 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  30.39 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  40.66 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  40.66 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  32.61 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  36.36 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  32.71 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  31.43 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  39 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  32.38 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  32.38 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  32.38 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  34.44 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  41.57 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  32.38 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  32.38 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  31 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  32.04 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  32.04 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3469  hypothetical protein  39.39 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3488  transcriptional regulator, PadR family  39.39 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00705716  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  33.71 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  34.31 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  32.58 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  32.99 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  39.33 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  32.04 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  31.07 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  40.59 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
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NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  35.58 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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