More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3281 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  218  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  81.13 
 
 		 116 aa  174  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  78.1 
 
 		 111 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  67.96 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  68.93 
 
 		 115 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  52.43 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  59.62 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  51.46 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 114 aa  83.6  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  37.86 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  40.22 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  34 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  34 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  39.36 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  46.15 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  37 
 
 		 128 aa  66.6  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  40.95 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  32.08 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  39.53 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  37.23 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  32.65 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  40.95 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  39.02 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  36.36 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  29.63 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  43.16 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  41.58 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  36.17 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  25.47 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  39.22 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  42.11 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  36.25 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  36.17 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1270  PadR-like family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169455  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>