More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK3399 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  99.08 
 
 		 109 aa  219  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  99.08 
 
 		 109 aa  219  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  98.13 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  98.13 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  97.2 
 
 		 107 aa  214  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  95.33 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  95.33 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  95.33 
 
 		 107 aa  207  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  95.15 
 
 		 103 aa  201  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  60 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3469  hypothetical protein  66.67 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3488  transcriptional regulator, PadR family  66.67 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00705716  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  52.53 
 
 		 111 aa  120  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  48 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  48 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  48 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  48 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  48 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  48 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  48 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  47 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  51 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  44.12 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  45 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  47.17 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  39.05 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  42.57 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  42.57 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  42.57 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  42.57 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 110 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  39.81 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  37.76 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  46.32 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  43 
 
 		 110 aa  87.4  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  41.35 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  39.25 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  39.22 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  43.96 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  41.05 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  41.41 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  38.46 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  38.61 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  38.46 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  39 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  38.53 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  37 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  39.76 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  37.86 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  37.25 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  38.68 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  37.11 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  41.24 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
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NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  41.11 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1270  PadR-like family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169455  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  28.97 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  32.71 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
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NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  29.63 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  32.41 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_2071  PadR-like family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202752  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  40.45 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  35.11 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  40.45 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2542  hypothetical protein  33.98 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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