296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  100 
 
 		 114 aa  226  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  53.27 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  50.49 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  49.51 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  43.93 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  45.05 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  45.54 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  47 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  43.18 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  44.34 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 110 aa  86.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  43 
 
 		 110 aa  85.9  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  38.24 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  38.24 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  37.25 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  37.25 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  32.67 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  41 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  40.22 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  31.37 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  35.24 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  31.37 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  44.32 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  44.32 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  44.32 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  33.71 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  43.18 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  43.18 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  38.32 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  32.35 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  39 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  43.48 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  35.09 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  41.57 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  41.57 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  32.71 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  32.69 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  32.71 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  34.31 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  42.86 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  41.76 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  41.05 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  45.98 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
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NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  35.24 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  37.76 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
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NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_2172  transcriptional regulator, PadR-like family  40.66 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  41.49 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  37.25 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  36.17 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  31.73 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
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NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  33.98 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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