221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0782 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 
108 aa  223  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  61.11 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  62.38 
 
 
114 aa  143  8.000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  58.82 
 
 
124 aa  139  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  61.76 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  57.41 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  55.24 
 
 
110 aa  123  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  39.22 
 
 
119 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 
108 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
103 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  42.11 
 
 
126 aa  87  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  35.85 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
113 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  39.58 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  48.04 
 
 
107 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  36.46 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  40.59 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  42.42 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  40.59 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  40.59 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  39.6 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  37.11 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  37.11 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  38.61 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  38.14 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  37.11 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  36.63 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  42.2 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  37.11 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  37.11 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  37.11 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  41 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  37.11 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  37.11 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  37.11 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  37.11 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  35.85 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  37.62 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  41.3 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  34.65 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  40 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  39 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  39 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  39 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  39 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  39 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  38 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  35.79 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  36.08 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
188 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 
109 aa  66.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  36.96 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  39.6 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  30.19 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  36.36 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  33.33 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  38.38 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  38.38 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  36.36 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3469  hypothetical protein  39.18 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0557218  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3488  transcriptional regulator, PadR family  39.18 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00705716  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  32.61 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal 
 
 
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NC_008527  LACR_2356  PadR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  29.9 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  31.73 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
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NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  33.02 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  28.28 
 
 
109 aa  62  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal 
 
 
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NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  33.02 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  38.46 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
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