More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1313 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  45.45 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  38.68 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  44.55 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  38.46 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  37.74 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  38.32 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  44.9 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  42.42 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  37.74 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  38 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  48.94 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  38.78 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  35.45 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  36.17 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  36.46 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  39.78 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  31.37 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  37.23 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  40.62 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  38 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  33.01 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  35.24 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  35.24 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  33.01 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  44.58 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  43.37 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  32.04 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  36.08 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  31.73 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  34.74 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  31 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.86 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  31 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  34.29 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  32.38 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>