More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1408 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 118 aa  236  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  75.89 
 
 		 124 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  72.17 
 
 		 118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  72.17 
 
 		 118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  72.17 
 
 		 118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  67.92 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  59.26 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  52.38 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 117 aa  106  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  41.12 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 116 aa  87.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  43 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  35.64 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.31 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  39.25 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  34.02 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  34.58 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  31.07 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  38.64 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  38.95 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  31.52 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  40.86 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  31.52 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  37.62 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  36.08 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  31.07 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  30.43 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  29.35 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  41.57 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  37.5 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  43.02 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  28.04 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  34.44 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  31.11 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  40.66 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  39.36 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>