More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3822 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 114 aa  228  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  45.37 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  43.64 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  44.66 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  41.12 
 
 		 118 aa  98.2  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  40.95 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  38.71 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  30.1 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  39.8 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  42.55 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  30.1 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  36.63 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  41.94 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  45.05 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  32.73 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  35.19 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  41 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  41.05 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  32.71 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  42 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  38.68 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  31.13 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  35.56 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  37.74 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  31.48 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  43.02 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  31.73 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  31.07 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  34 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  34 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  29.13 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  40.24 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  34 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  34 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  34 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  34 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  34 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  29.52 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  34 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  32.99 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  41.98 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.1 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>