211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3772 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 124 aa  253  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  58.33 
 
 		 114 aa  127  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  42.34 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  46.6 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  41.23 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  39.62 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  40.24 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  47.5 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  34.31 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  38.82 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 372 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  30.69 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  26.67 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 109 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  30.48 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  31.68 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  32.04 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  37.08 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0868  PadR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.343891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  36.51 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  29.81 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  32.26 
 
 		 117 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  31.03 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  33.66 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  40.74 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  34.21 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  43.21 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  36.36 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  30.12 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 334 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  35.63 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  34.21 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 205 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>