114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1369 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  43.16 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  43.16 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  43.16 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  43.16 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  42.11 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  42.11 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  41.05 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  39.36 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  39.13 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  38.3 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  38.3 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  38.3 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  38.38 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  31.13 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  40.21 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.04 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  41.43 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  28.7 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  41.25 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  34.44 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 334 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  50.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 250 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  31.46 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 263 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 240 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  31 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  37.31 
 
 		 277 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  40.85 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  43.21 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 316 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 236 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  39.68 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  32.29 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 214 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 200 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 198 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  36.76 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  32.88 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  36.21 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  39.71 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  37.1 
 
 		 209 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 180 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>