222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0164 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  59.88 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  57.49 
 
 		 197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  57.41 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  43.33 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  42.22 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2383  transcriptional regulator PadR-like  49.4 
 
 		 211 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5629  transcriptional regulator, PadR-like family  45.68 
 
 		 287 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1092  PadR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148193 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 152 aa  118  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0022  PadR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 235 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1530  PadR-like family regulatory protein  40.41 
 
 		 234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0030  PadR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000428656  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0028  PadR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1174  PadR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1454  PadR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0027  PadR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1070  PadR-like family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 141 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.408045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  50.5 
 
 		 150 aa  104  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  38.41 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  38.41 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  55.06 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  37.42 
 
 		 141 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  41.01 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  46 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  46 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  35.76 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  46 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  34.76 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  33.94 
 
 		 207 aa  88.6  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.333448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  34.57 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3405  transcriptional regulator, PadR family  35.19 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  35.19 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  34.57 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  36.72 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 181 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 236 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1057  PadR family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1242  PadR-like family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000724616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1098  PadR-like family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.216996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  41.49 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  39.33 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  45.45 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4192  hypothetical protein  53.09 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3926  transcriptional regulator PadR-like  40 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  38.96 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  44.05 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  41.56 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  45.57 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  41.25 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  50 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  41.56 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2382  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000270616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>