196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1092 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1092  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 281 aa  564  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5629  transcriptional regulator, PadR-like family  81.88 
 
 		 287 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  66.4 
 
 		 254 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  61.23 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  67.46 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  67.46 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  67.46 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0022  PadR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1530  PadR-like family regulatory protein  65.9 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0030  PadR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000428656  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0028  PadR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1174  PadR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 207 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1454  PadR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 207 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0027  PadR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 207 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  63.07 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 209 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  53.66 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  44.26 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  43.85 
 
 		 191 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  48.48 
 
 		 218 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  45.78 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  45.78 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 152 aa  115  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  41.51 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  37.89 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  46 
 
 		 196 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 176 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 201 aa  95.9  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 210 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  36.53 
 
 		 150 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  33.5 
 
 		 204 aa  89.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 207 aa  89  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  33.54 
 
 		 207 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  33.54 
 
 		 207 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  33.54 
 
 		 207 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  33.54 
 
 		 207 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 207 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 207 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 207 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1242  PadR-like family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000724616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3405  transcriptional regulator, PadR family  32.28 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.333448 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  32.28 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2383  transcriptional regulator PadR-like  34.03 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1057  PadR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1098  PadR-like family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.216996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3926  transcriptional regulator PadR-like  31.09 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.171272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  39.86 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4192  hypothetical protein  33.51 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  44.93 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  31.06 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1070  PadR-like family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.408045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  30.37 
 
 		 180 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  39.51 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  30.88 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 371 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  36.25 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  30.95 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  40.54 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  36.46 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2382  transcriptional regulator, PadR-like family  41.86 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000270616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>