268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5885 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 334 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  50.32 
 
 		 255 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  43.55 
 
 		 217 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  46.75 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 203 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  42.55 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  43.17 
 
 		 195 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  42.38 
 
 		 271 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  42.76 
 
 		 180 aa  113  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  43.36 
 
 		 205 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  42.76 
 
 		 250 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 219 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  41.78 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 189 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  42.58 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 220 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 220 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 213 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  40.82 
 
 		 206 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  40.41 
 
 		 230 aa  93.2  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 176 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 234 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 152 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  29.65 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  38.04 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  32.82 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 208 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  32.76 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  37.89 
 
 		 191 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  32.54 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  36.84 
 
 		 197 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 186 aa  67  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  38.46 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 196 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 181 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3405  transcriptional regulator, PadR family  33.98 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  33.98 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  35.87 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.333448 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 151 aa  64.7  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  37.04 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  36.25 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 144 aa  62  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  36.25 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  36.25 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0868  PadR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 131 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.343891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  29.05 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  39.34 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5629  transcriptional regulator, PadR-like family  42.19 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1092  PadR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>