203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3245 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  55.32 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2027  PadR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 122 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  43.46 
 
 		 217 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  44 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  47.16 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  43.42 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  41.1 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  46.53 
 
 		 316 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 249 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  42.95 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  41.84 
 
 		 263 aa  99.4  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  39.58 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  42.34 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  40.71 
 
 		 277 aa  95.5  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  39.86 
 
 		 271 aa  94.7  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 277 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 325 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  41.84 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  39.86 
 
 		 334 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  50.59 
 
 		 250 aa  88.6  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 305 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  33.8 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  47.73 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  39.78 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  31.79 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  45.56 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  30.14 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 152 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  35.96 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0257  PadR-like family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.688935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  31.88 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  39.76 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  39.76 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  39.76 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  39.76 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  39.76 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1057  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 151 aa  62  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5629  transcriptional regulator, PadR-like family  40.3 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1092  PadR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148193 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  32.52 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1098  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.216996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1242  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000724616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4198  PadR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1595  PadR-like family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>