236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6014 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6014  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  620  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  77.51 
 
 		 305 aa  225  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  53.1 
 
 		 250 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  49.71 
 
 		 203 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  47.59 
 
 		 217 aa  142  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  49.38 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  55.4 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  52.52 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  44.2 
 
 		 180 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  51.41 
 
 		 195 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  49.09 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  43.56 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  52.76 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  48.91 
 
 		 205 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  47.89 
 
 		 251 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 213 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 240 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 220 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 220 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 234 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 189 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  35.76 
 
 		 195 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  44.08 
 
 		 219 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  40.56 
 
 		 206 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 230 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  39.86 
 
 		 183 aa  89  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  44.21 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  43.16 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4987  PadR-like family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 152 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4521  PadR-like family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3162  PadR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5141  PadR-like family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.244499  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5718  PadR-like family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.86173  normal  0.252047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  39.76 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  39.18 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 		 196 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 131 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 186 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1409  transcriptional regulator protein  38.89 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  46.99 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 226 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8287  transcriptional regulator protein-like protein  34.78 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  40 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 157 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0022  PadR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1530  PadR-like family regulatory protein  46.15 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0024  PadR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  38.79 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1174  PadR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1454  PadR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0030  PadR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000428656  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0028  PadR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0027  PadR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 		 148 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 155 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5137  PadR-like family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.389503  normal  0.327359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  44.29 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4273  PadR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  28.97 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  36.3 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0257  PadR-like family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.688935 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  40.54 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3009  transcriptional regulator, PadR-like  39.74 
 
 		 141 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  41.33 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5629  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>