More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2175 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 114 aa  235  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  58.49 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  49.06 
 
 		 115 aa  105  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  43.86 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  42.42 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  35.24 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  41.35 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  35.24 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  38.71 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  34.31 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  37.74 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  35 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  40.54 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  38.61 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  39.62 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  34 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  34.74 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  34.26 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  33.02 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  39.36 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  32.08 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  30.19 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1244  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  32.32 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  30.84 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  29.13 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  30.48 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  33.02 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  33.02 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  32.35 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  34.86 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 334 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  33.66 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  43.42 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  33.66 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  32.71 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  32.08 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  30.69 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>